Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc1Q3UPH1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms