Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms