Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mccc2Q3ULD5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mccc2Q3ULD5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mccc2Q3ULD5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms