Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dtx3lQ3UIR3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dtx3lQ3UIR3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dtx3lQ3UIR3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms