Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH06

Rreb1, Ras-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rreb1Q3UH06 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rreb1Q3UH06 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rreb1Q3UH06 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rreb1Q3UH06 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rreb1Q3UH06 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rreb1Q3UH06 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rreb1Q3UH06 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rreb1Q3UH06 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rreb1Q3UH06 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rreb1Q3UH06 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rreb1Q3UH06 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rreb1Q3UH06 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rreb1Q3UH06 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rreb1Q3UH06 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms