Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mcrip1Q3UGS4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms