Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp36Q3UFY0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp36Q3UFY0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms