Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Parp8Q3UD82 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Parp8Q3UD82 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms