Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U6N9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U6N9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U6N9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U6N9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U6N9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms