Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms