Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Palb2Q3U0P1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palb2Q3U0P1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms