Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hhla1Q3TYV2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms