Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21440Q3TTD8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms