Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Alkbh5Q3TSG4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh5Q3TSG4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms