Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TEI4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TEI4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TEI4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TEI4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TEI4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TEI4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TEI4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms