Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3ip1Q149C2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf3ip1Q149C2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf3ip1Q149C2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms