Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms