Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp2b3Q0VF55 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp2b3Q0VF55 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2b3Q0VF55 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms