Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms