Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cass4Q08EC4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms