Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssrp1Q08943 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssrp1Q08943 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms