Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 675.1 ms