Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnma1Q08460 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms