Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata4Q08369 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms