Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnn1Q08091 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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