Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn3Q07409 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms