Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrstQ06666 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrstQ06666 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrstQ06666 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms