Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Fmn1Q05860 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fmn1Q05860 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms