Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox12Q04890 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sox12Q04890 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms