Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox10Q04888 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms