Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk16Q04735 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk16Q04735 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk16Q04735 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms