Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nf1Q04690 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms