Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcr5Q04683 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cxcr5Q04683 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms