Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnb1Q03717 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kcnb1Q03717 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnb1Q03717 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms