Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tff2Q03404 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tff2Q03404 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms