Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col6a2Q02788 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms