Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gjb5Q02739 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms