Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Muc1Q02496 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Muc1Q02496 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Muc1Q02496 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Muc1Q02496 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Muc1Q02496 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Muc1Q02496 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Muc1Q02496 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Muc1Q02496 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Muc1Q02496 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Muc1Q02496 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms