Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcd1Q02242 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcd1Q02242 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms