Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snai1Q02085 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snai1Q02085 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms