Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly9Q01965 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly9Q01965 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms