Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme2Q01768 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nme2Q01768 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms