Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Top2aQ01320 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Top2aQ01320 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Top2aQ01320 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms