Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SelpQ01102 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SelpQ01102 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SelpQ01102 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SelpQ01102 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SelpQ01102 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelpQ01102 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SelpQ01102 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SelpQ01102 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SelpQ01102 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SelpQ01102 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SelpQ01102 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelpQ01102 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelpQ01102 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelpQ01102 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms