Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Pde1bQ01065 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms