Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4dQ01063 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde4dQ01063 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde4dQ01063 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms