Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms