Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6stQ00560 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms