Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms