Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shc1P98083 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shc1P98083 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shc1P98083 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc1P98083 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms