Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfdP97946 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfdP97946 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfdP97946 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfdP97946 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfdP97946 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfdP97946 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms